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Corre Marie-Hélène

Identification et caractérisation de composés produits par des bactéries environnementales pour la lutte biologique contre Legionella pneumophila

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Index

École doctorale :

  • Gay Lussac - Sciences pour l'environnement

UFR ou institut :

  • UFR des sciences fondamentales et appliquées (SFA)

Secteur de recherche :

  • Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie

Section CNU :

  • Biochimie, biologie moléculaire

Résumé

  • Français
  • English
 

Français

Identification et caractérisation de composés produits par des bactéries environnementales pour la lutte biologique contre Legionella pneumophila

Les circuits et réseaux d’eau subissent épisodiquement des problèmes de contamination par des microorganismes tels que Legionella pneumophila, conduisant à la dégradation de la qualité microbiologique de l’eau circulante. De nouveaux moyens de traitements doivent être mis en place de façon notamment à limiter l’usage de biocides chimiques. Ce travail de thèse s’inscrit dans cette problématique et a pour objectif d’identifier de nouveaux composés actifs contre L. pneumophila en tenant compte de son comportement et de ses interactions au sein de son microenvironnement. De manière à obtenir des composés produits par des souches bactériennes appartenant à la même niche écologique que L. pneumophila, une campagne de prélèvement d’eau a été réalisée. Un total de 273 isolats environnementaux ont été isolés et testés contre L. pneumophila. Les résultats obtenus indiquent que 178 de ces isolats (65%) présentent une activité anti-Legionella. Quatre souches ont ensuite été sélectionnées (Aeromonas bestiarum SW257, Rahnella aquatilis SW265, Flavobacterium spp. PW52 et Pseudomonas spp PW329) et les composés actifs produits ont été caractérisés. A. bestiarum SW257 produit un peptide anti-Legionella. Flavobacterium sp. PW52 produit un mélange de composés anti-Legionella ayant des propriétés tensioactives, les flavolipides. Pseudomonas sp. PW329 produit des composés organiques volatiles, identifiés par SPME-GC-MS, actifs contre L. pneumophila. Enfin, R. aquatilis SW265 produit un sidérophore à activité anti-Legionella.

Mots-clés libres : Legionella, eau douce, communautés bactériennes, biosurfactants, composés antimicrobiens, sidérophore. .

    Rameau (langage normalisé) :
  • Legionella pneumophila
  • Eau douce
  • Surfactants biologiques
  • Pseudomonas
  • Acanthamoeba castellanii

English

Identification and characterization of anti-Legionella compounds produced by environmental waterborne bacteria

Water is essential to sustain life and water sources used for human consumption must be biologically safe, to avoid any risk for health. Indeed, the most common and widespread health risk associated with drinking water are infectious diseases caused by pathogenic microorganisms such as Legionella pneumophila. However, more efforts are needed to control disinfection by-products and minimize people exposure to potentially hazardous chemicals while maintaining adequate disinfection to ensure good water quality. Thus, this work aimed to find natural antibacterial compounds to control L. pneumophila growth using bacteria from freshwater environments. Environmental aquatic bacteria were sampled from five freshwater sources to get a large culturable bacterial collection. A total of 273 bacterial isolates were recovered and screened for their ability to produce anti-Legionella compounds. Among those, 178 (65%) were shown to be active against L. pneumophila. Four strains (Aeromonas bestiarum SW257, Rahnella aquatilis SW265, Flavobacterium spp. PW52, and Pseudomonas spp PW329) were next selected for the characterization of their active compounds. A. bestiarum SW257 produces an anti-Legionella peptide, and Flavobacterium spp PW52 produces a mixture of anti-Legionella compounds with surface active properties, named flavolipids. Finally Pseudomonas sp. PW329 delivers many volatile organic compounds, and R. aquatilis SW26 produces a anti-Legionella siderophore.

Keywords : Legionella, freshwater environments, bacterial communities, biosurfactants, antimicrobials compounds, siderophore. .

Notice

Diplôme :
Doctorat d'Université
Établissement de soutenance :
Université de Poitiers
UFR, institut ou école :
UFR des sciences fondamentales et appliquées (SFA)
Laboratoire :
Ecologie et biologie des interactions - EBI (Poitiers)
Domaine de recherche :
Aspects Moléculaires et Cellulaires de la Biologie
Directeur(s) de thèse :
Jean-Marc Berjeaud, Julien Verdon
Date de soutenance :
10 décembre 2018
Président du jury :
Sylvie Chevalier
Rapporteurs :
Ali Ladram, Isabelle Schalk
Membres du jury :
Jean-Marc Berjeaud, Julien Verdon, Christophe Ginevra, Sophie Lecomte

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